利用全基因组重测序或简化基因组测序(dd-RAD)技术获得某物种自然群体各亚群的基因组信息,通过与参考基因组比对或聚类分析的方法得到大量变异信息,基于SNP信息讨论群体的遗传结构、基因交流情况、物种形成机制以及群体进化动态等生物学问题。
群体进化研究可以获取物种的变异信息,从而获得生物群体的遗传特征。探究群体进化可以为动植物遗传育种和濒临灭绝的动植物保护等提供理论依据,同时也可以为地球地质、生态、气候、历史人类活动变化的研究提供生物学佐证。
产品参数
基于重测序 | 基于简化 | |
测序平台及模式 | Illumina Novaseq, PE150 | |
测序深度 | >50x/个体 | 混合建库;Tag数≥20万,平均10x/Tag |
项目周期 | 标准分析40天 | 标准分析50天 |
样本选择 | 同一物种自然群体的不同亚种(或品系),每个亚群样本数≥10; 群体数≥3;总体不少于30个样本 | |
DNA样本量 | 总量≥0.5 μg,浓度≥10 ng/μl (单个样本) | 总量≥0.5 μg,浓度≥10 ng/μl (总样本) |
参考基因组 | 必须有参 | 无参或参考基因组较大 |
分析结果展示
取样分布图和进化树
群体分层分析
群体结构分析