BSA(Bulked Segregant Analysis):称为混合分组分析法,是一种利用极端性状进行功能基因定位的一种方法。主要是将两组具有极端性状的群体进行混池测序,比较两组群体在多态位点(SNP)的等位基因频率(AF)是否具有显著差异,即而将目标性状基因定位在染色体区段上。
自然突变基因定位:QTLseq
人工诱变基因定位:Mut Map
产品参数
研究类型 | 样本选取 | 测序平台 | 测序深度 | 项目周期 |
QTL | 亲本:2个极端表型亲本 子代:极端表型个体混池, 每个池至少20个个体 | Illumina Novaseq PE400, 150*2 | 亲本 ~20× 子代混池 ~30× | 35天 |
MutMap | 亲本:1个野生型表型亲本子代:极端表型个体混池, 每个池至少20个个体 | 亲本 ~20× 子代混池 ~30× |
信息分析内容
分析结果展示
候选基因定位
基因定位
Pu H, Hui J, Zhu C, et al. Sparse panicle1 is required for inflorescence development in Setaria viridis and maize[J]. Nature Plants, 2017, 3(5):17054.