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宏基因组测序研究
宏基因组学(Metagenomics)研究通过全基因组鸟枪法(Whole Genome Shotgun，WGS)测序策略，将提取获得的微生物组总DNA随机打断为短片段，并构建合适长度的插入片段文库，对这些文库进行双端(Paired-end，PE)高通量测序，从而能全面精细地展示整个菌群的功能代谢谱和物种精细组成谱，进而在组成和功能水平分别挖掘关键生物标记物，从原理上阐明微生物群落在生态系统中发挥作用的根本机制。
宏基因组测序项目流程
微生物组总DNA提取→DNA片段化→连接接头序列→纯化、富集DNA片段→测序文库定量→上机进行高通量测序→生信分析
宏基因组测序产品特点
1、直接对群落样本中的基因片段进行测序，真实再现群落复杂而精密的生态功能；
2、样本类型涵盖各类生境，微量提取成功率高；
3、使用Illumina NovaSeq超高通量测序平台，速度更快周期更短；
4、功能+物种，双管齐下；拼接+不拼接，各取所长，真正实现对物种和功能的“高分辨率”精确定量；
5、根据样本、数据特征，自动选择最佳分析流程，多种功能注释数据库可选，最优化宏基因组功能代谢谱注释；
6、通过多种多变量统计分析和机器学习方法，系统、深入地挖掘宏基因组大数据中差异相关的关键物种和关键功能，精确识别关键生物标记物。
技术路线
功能—物种一致性分析
差异KO的代谢通路映射图
GO富集网络图
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