质粒 & BAC克隆子的全基因组测序,是指基于二代高通量测序技术和/或三代单分子测序技术,对质粒或 BAC 克隆子的全基因组进行测序、拼接,利用生物信息分析手段,基于测序深度、GC 含量以及序列比对结果,挑选质粒或 BAC 克隆子的全基因组序列。
产品参数
产 品 | 文库插入片段大小(bp) | 测序平台及测序模式 | 测序深度 | 交付指标 | 项目周期 |
G < 20 kb | 400 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 | 数据量 | 30 个自然日 |
G < 20 kb | 400 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 | 数据量 | 35 个自然日 |
G ≥ 20 kb | 400 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 | 零 Gap | 45 个自然日 |
20,000 | PacBio | ~100 |
一般而言,基因组大小在20 kb以下的质粒或 BAC 克隆子,采用 Illumina MiSeq 或Illumina HiSeq 平台能得到接近于完成图的效果(不同样本,拼接效果会有差异); 基因组大小超过20 kb 的质粒或 BAC 克隆子,建议抽提总DNA,参考细菌完成图的方式获得全基因组序列图谱。
信息分析内容
序 号 | 分析项目 | 类 别 | 分 析 | 备 注 |
1 | 原始数据整理统计 | A | ||
2 | 数据质控 | A | ||
3 | 数据获取 | A | ||
4 | 基因组序列拼装与分析 | A | ||
5 | 质粒或 BAC 克隆子序列挑取 | A |