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商品描述

质粒 &  BAC克隆子的全基因组测序,是指基于二代高通量测序技术和/或三代单分子测序技术,对质粒或 BAC 克隆子的全基因组进行测序、拼接,利用生物信息分析手段,基于测序深度、GC 含量以及序列比对结果,挑选质粒或 BAC 克隆子的全基因组序列。



产品参数




产 品

文库插入片段大小(bp)

测序平台及测序模式

测序深度

交付指标

项目周期

G < 20 kb

400 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100

数据量

30 个自然日

G < 20 kb

400 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100

数据量

35 个自然日

G ≥ 20 kb

400 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100

零 Gap

45 个自然日

20,000

PacBio

~100



一般而言,基因组大小在20 kb以下的质粒或 BAC 克隆子,采用 Illumina MiSeq Illumina HiSeq 平台能得到接近于完成图的效果(不同样本,拼接效果会有差异); 基因组大小超过20 kb 的质粒或 BAC 克隆子,建议抽提总DNA,参考细菌完成图的方式获得全基因组序列图谱。


技术路线

质粒&BAC克隆子基因组测序技术路线.jpg


信息分析内容



序 号

分析项目

类 别

分 析

备 注

1

原始数据整理统计

A



2

数据质控

A



3

数据获取

A



4

基因组序列拼装与分析

A



5

质粒或 BAC 克隆子序列挑取

A




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