MiSeq性能参数

Illumina MiSeq测序时间和数据量

Illumina MiSeq读取量比对

工作流程

Illumina MiSeq四大特性

1、较短的实验周期：从样品制备开始需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。

2、便捷的样品制备流程：需50ngDNA模板，2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。

3、测序原理：MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理。

4、完整的整合功能：MiSeq可以独立完成簇生成，双向测序及数据分析工作，让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。

Illumina MiSeq应用范围

1、转录组测序

派森诺MiSeq测序平台是基因组已测序物种的转录组分析平台。公司技术团队目前已完成了包括斑马鱼在内的多种植物、动物的转录组测序及分析。

2、宏基因组16S rDNA单V区测序

对16s rDNA的单V区(V3V4)进行高通量测序，鉴定细菌群和古生菌群。派森诺的技术团队使用Illumina MiSeq测序16S rDNA V4区并结合Roche 454 FLX+测序16S rDNA V1~V3区成功的对鸡的肠道环境细菌进行了鉴定。

3、Small RNA测序

1*35bp的读长配合了小RNA的测序长度，速度快，灵敏度高。派森诺的技术团队目前已完成了鹅的小RNA测序和多种中草药的小RNA测序。

4、重测序：包括全基因组重测序、简化基因组测序、外显子测序。

Illumina MiSeq非常适用于对微生物基因组的重测序，每次运行即可完成一个微生物基因组测序。2011年12月27日，派森诺的技术团队利用MiSeq一次运行同时完成了乳酸菌（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重测序，基因组覆盖深度为分别为404倍和213倍，比对至参考序列，基因组实现全覆盖，同时检测到了多种结构变异，包括插入、缺失和SNP位点，并且检测到了全部质粒。